Plataforma de biología computacional para el análisis de big data de la biodiversidad de islas (ISLAND-OMICS)

Este proyecto se desarrollará en el marco del Programa Momentum del CSIC, una iniciativa dentro del Plan Nacional de Competencias Digitales del Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia (PRTR), en colaboración con el Grupo de Ecología y Evolución en Islas (GEEI) del IPNA. Con la vocación de formar una nueva generación de profesionales con competencias digitales avanzadas, Momentum se centra en atraer, formar y retener talento altamente cualificado en ciencia y tecnología, fortaleciendo así la capacidad de investigación e innovación en España. El proyecto se estructurará en cuatro objetivos principales:

• Ensamblaje cromosómico de un genoma de novo mediante secuenciación PacBio de lectura larga, con andamiaje basado en datos Hi-C y anotación genética con transcriptomas.
• Ensamblaje de genomas mediante re-secuenciación de baja cobertura, mapeados con ANGSD a un genoma de referencia, con análisis en un marco geoespacial.
• Aplicación de Inteligencia Artificial a datos masivos de metabarcoding para la identificación y eliminación de errores derivados de PCR, secuenciación y copias nucleares.
• Identificación y análisis de conjuntos de datos genómicos/metagenómicos públicos mediante herramientas bioinformáticas, incluyendo ensamblaje y análisis de genomas en un entorno específico.

Este enfoque permitirá desarrollar competencias avanzadas en bioinformática, genómica y aplicación de inteligencia artificial en el análisis de datos masivos, alineándose con los objetivos estratégicos del Programa Momentum.